20世紀末の現代、高校生の火野ヤマトは体育館で自(zì )分(fèn )の名(míng )を呼(hū )ぶ巨(jù )大(dà )な「魔(mó )神」の幻影を見る。幻を振り払おうとするヤマトであったが、「魔神」とともに「見知らぬ女性」の声が聞(wén )こえたとき、ヤマトは声に歩み寄ってしまう。 ヤマトが「魔神」によって運ばれた先は1万年前に地殻変動で海に沈んだはずのムー大陸であった。訳(yì )が判(pàn )らないヤマトに対(duì )しムーの民たちは彼を「マジンガーが選んだ救世主」と持ち上げる。彼らムーの民の守護神こそ、彼を現代(dài )から過(guò )去(qù )に運んだゴッドマジンガーであった。そんな折、ムーの民と拮抗する勢力であるドラゴニ